Pesantren Al-Amanah Sempon adalah pesantren yang berorientasi pada kelestarian lingkungan hidup yang memfokuskan pengajaran pada pentingnya menjaga keberlangsungan lingkungan. Siswa diajarkan cara-cara untuk menjadi agen perubahan dalam menjaga kelestarian lingkungan hidup. Mereka diajarkan tentang pentingnya penggunaan energi terbarukan, pengurangan limbah, dan penghematan air. 

Selain itu, pesantren ini juga mendorong siswa untuk mengembangkan keterampilan pertanian organik dan pemanfaatan lahan yang ramah lingkungan. Hal ini akan membantu siswa memahami pentingnya menjaga keselarasan antara manusia dan alam, serta mempersiapkan mereka menjadi generasi yang bertanggung jawab dalam menjaga kelestarian lingkungan hidup